Actualmente, la Fundación CEDE cuenta con un Patronato formado por 23 altos ejecutivos de las principales empresas del país, bajo la presidencia de Isidro Fainé, que aportan su experiencia y talento en favor de la clase directiva española. La presidencia de honor la ostenta Su Majestad El Rey.
La entidad cuenta también con el Senado de CEDE, un órgano consultivo y de representación formado por personalidades de reconocido prestigio.
La Fundación CEDE agrupa 37 asociaciones, que suman más de 160.206 directivos de distintos ámbitos territoriales y sectores, y cuyos presidentes forman parte del Consejo Directivo de la Fundación.